梧桐山有丰富的动植物资源，1996年，梧桐山风景区管理处，联合中科院北京植物所、中山大学生命科学院、仙湖植物园等多家单位开展调查，历时4年多，《梧桐山风景区动物与昆虫资源调查》于2000年9月14日通过了由市科技局组织的鉴定，《梧桐山风景区植物资源调查》于2001年10月19日通过了由市城管办主持的鉴定，被专家组一致认为达到国内同类研究项目的先进水平。
经调查，梧桐山风景区分布有各类野生植物240科，1419种，其中苔藓植物42科86种，蕨类植物30科109种，裸子植物5科9种，被子植物163科1219种；根据用途对资源植物进行分类，梧桐山风景区有各类资源植物968种，其中药用植物359种，油脂植物150种，蜜源植物114种，材用植物42种，还有大量的食用、园林绿化等资源植物，有国家一级重点保护的桫椤，二级保护的红皮油茶、大苞白山茶、野茶树，三级保护的穗花杉、白桂木、粘木等珍稀濒危植物。
桫椤：树形蕨类，主干高达1－3米，树柄和叶轴粗壮，深棕色，叶片大，长达3米，树形别致，体态优美。桫椤喜欢生长在既温暖又潮湿的气候环境中，分布于贵州、四川、广东和台湾。桫椤历史悠久古老，是恐龙时代的植物，是恐龙的食物之一，被称为化石植物。
分布在梧桐山风景区内的野生动物有24目64科196种，其中鸟类13目32科112种，兽类6目16科30种，爬行类3目10科36种，两栖类2目6科18种。国家重点保护的动物有一级保护的蟒蛇，二级保护的鸢、赤腹鹰、褐翅鸦鹃、穿山甲、小灵猫、水獭、三线闭壳龟、山瑞鳖、虎纹蛙等。
分布在梧桐山风景区内的昆虫有106科，411属，537种，其中竹节虫目和鳞翅目分别发现一新种。
